ד"ר בועז זיסו משמש כמרצה בכיר לארכיאולוגיה במחלקה ללימודי ארץ-ישראל וארכיאולוגיה ע"ש מרטין (זוס) באוניברסיטת בר-אילן, וכחבר במכון לארכיאולוגיה שם. ד"ר זיסו סיים בציון מעולה עבודת דוקטור באוניברסיטה העברית בשנת 2002 בנושא: "היישוב הכפרי ביהודה משלהי תקופת הבית השני עד ימי מרד בר-כוכבא", בהנחיית פרופ' דן בר"ג. הוא המשיך בלימודי פוסט-דוקטורט, באמצעות מלגה של יד-הנדיב (קרן רוטשילד) בתכנית להיסטוריה עתיקה וארכיאולוגיה ים-תיכונית באוניברסיטת קליפורניה שבברקלי, ארה"ב. לאחר מכן קיבל מלגה מחקר במכון למדעי הרוח באוניברסיטת קלגרי שבקנדה, שם כתב ספר על עיר הקברים של ירושלים בימי הבית השני, יחד עם פרופ' עמוס קלונר, שהתפרסם בשפה האנגלית בהוצאה המדעית Peeters. במהלך השנים, ביצע חפירות וסקרים ארכיאולוגיים רבים ברחבי הארץ, חלקם במסגרת רשות העתיקות, שם עבד בשנים 1987 - 2002. החפירות והסקרים התמקדו בירושלים, בכתף יריחו ובשפלת יהודה. באחת החפירות, בחורבת עתרי, הסמוכה לבית גוברין, חשף זיסו, יחד עם אמיר גנור, כפר יהודי מתקופת הבית השני, במרכזו מבנה ציבור ששימש כפי הנראה כבית כנסת. במהלך השנים פרסם זיסו שלושה ספרים ויותר מ-130 מאמרים מדעיים העוסקים במחקר ירושלים וארץ-יהודה בתקופות ההלניסטית, הרומית והביזאנטית.
